Table 3 Comparison of cellulose machinery across four gut fungal strains
| Â | Number of transcripts (# dockerin containing transcripts)a | |||
|---|---|---|---|---|
C. churrovis | N. californiae | A. robustus | P. finnis | |
Hemicellulases | ||||
 GH11–12 | 63 (6) | 67 (15) | 30 (8) | 35 (9) |
 GH11 | 60 (6) | 59 (14) | 30 (8) | 31 (9) |
 GH43 | 59 (10) | 35 (15) | 16 (12) | 11 (9) |
 GH10 | 15 (2) | 67 (25) | 15 (6) | 16 (7) |
 GH39 | 3 (2) | 9 (8) | 4 (4) | 1 (1) |
 GH30 | 2 (2) | 2 (1) | 2 (2) | 1 (1) |
Accessory enzymes | ||||
 Carbohydrate esterase | 47 (1) | 43 (7) | 28 (3) | 22 (5) |
 Pectin lyase | 45 (2) | 35 (0) | 5 (0) | 9 (0) |
 Polysaccharide deacetylase | 42 (1) | 93 (2) | 58 (2) | 48 (2) |
 Rhamnogalacturonate lyase | 4 (3) | 4 (1) | 3 (1) | 2 (1) |
 Pectinesterase | 4 (0) | 12 (0) | 5 (0) | 6 (0) |
 GH88 | 0 (0) | 2 (2) | 0 (0) | 1 (1) |
Cellulases | ||||
 GH9 | 29 (11) | 25 (13) | 15 (9) | 12 (9) |
 GH6 | 27 (8) | 22 (18) | 5 (3) | 8 (7) |
 GH45 | 26 (12) | 24 (14) | 13 (7) | 11 (7) |
 GH48 | 25 (5) | 24 (17) | 7 (5) | 14 (7) |
 GH1 | 20 (0) | 16 (0) | 11 (0) | 9 (0) |
 GH5 | 19 (1) | 48 (25) | 22 (8) | 27 (9) |
 GH3 | 16 (3) | 33 (4) | 16 (3) | 12 (2) |
 GH16 | 3 (1) | 15 (6) | 9 (2) | 5 (2) |
 GH8 | 2 (1) | 4 (2) | 1 (1) | 1 (1) |
 GH31 | 1 (0) | 7 (0) | 6 (0) | 1 (0) |
Total | 512 (77) | 646 (189) | 301 (84) | 283 (89) |