Table 2 Comparison of the crucial metabolic pathways among the five representative Clostridial strains

Carbohydrate metabolism

 Beta-1,4-d-mannosyl-N-acetyl-d-glucosamine degradation (PWY-7586)

Y

 Cellulose biosynthesis (PWY-1001)

Y

Y

 Cellulose degradation II (PWY-6788)

Y

Y

Y

Y

Y

 d-Galactose degradation V (Leloir pathway, PWY66-422)

Y

Y

Y

Y

 d-Galacturonate degradation I (GALACTUROCAT-PWY)

Y

Y

 Ethanol degradation IV (PWY66-162)

Y

Y

Y

Y

 Fucose degradation (FUCCAT-PWY)

Y

 GDP-mannose biosynthesis (PWY-5659)

Y

 Gellan degradation (PWY-6827)

Y

 Gluconeogenesis I (GLUCONEO-PWY)

Y

Y

Y

 Glycerol degradation I (PWY-4261)

Y

Y

Y

Y

Y

 Glycogen biosynthesis I (GLYCOGENSYNTH-PWY)

Y

Y

 Glycolysis I (GLYCOLYSIS)

Y

Y

Y

Y

Y

 Glycolysis III (ANAGLYCOLYSIS-PWY)

Y

Y

Y

 Lactose degradation III (BGALACT-PWY)

Y

 l-Ascorbate degradation II (PWY-6961)

Y

 l-Rhamnose degradation I (RHAMCAT-PWY)

Y

 Maltose degradation (MALTOSECAT-PWY)

Y

Y

 Pentose phosphate pathway (NONOXIPENT-PWY)

Y

Y

 Pyruvate fermentation to acetone (PWY-6588)

Y

Y

Y

Y

Y

 Pyruvate fermentation to butanoate (CENTFERM-PWY)

Y

 Sucrose biosynthesis II (PWY-7238)

Y

Y

Y

Y

Y

 Sucrose degradation III (PWY-621)

Y

Y

 TCA cycle VIII (REDCITCYC)

Y

Y

Y

 Trehalose degradation I (TREDEGLOW-PWY)

Y

 UDP-d-galactose biosynthesis (PWY-7344)

Y

Y

Y

Y

Y

 UDP-glucose biosynthesis (PWY-7343)

Y

Y

Y

Y

Y

Energy metabolism

 [2Fe-2S] iron-sulfur cluster biosynthesis (PWY-7250)

Y

Y

Y

Y

Y

 Hydrogen production (PWY-6759)

Y

Y

Y

Y

Y

 Hydrogen to dimethyl sulfoxide electron transfer (PWY0-1577)

Y

Y

Y

Y

Y

 Phosphatidylethanolamine biosynthesis I (PWY-5669)

Y

Y

Y

Y

 Sulfoquinovosyl diacylglycerol biosynthesis (PWYQT-4427)

Y

 Nitrogen fixation I (N2FIX-PWY)

Y

Y

Y

Y

 Superoxide radicals degradation (DETOX1-PWY)

Y

 Thioredoxin pathway (THIOREDOX-PWY)

Y

 Urate biosynthesis/inosine 5-phosphate degradation (PWY-5695)

Y

Metabolism of cofactors, vitamins and others

 Acetate conversion to acetyl-CoA (PWY0-1313)

Y

 Acetate formation from acetyl-CoA I (PWY0-1312)

Y

Y

Y

Y

Y

 Acyl-CoA hydrolysis (PWY-5148)

Y

 Phosphopantothenate biosynthesis I (PANTO-PWY)

Y

Y

Y

Y

Y

 Riboflavin metabolism (RIBOFLAVIN-PWY)

Y

Y

Y

Y

Y

 Fatty acid biosynthesis initiation I (PWY-4381)

Y

Y

 CDP-diacylglycerol biosynthesis III (PWY-5981)

Y

Y

Y

 Poly-hydroxy fatty acids biosynthesis (PWY-6710)

Y

Y

Y

Y

Y

 2,3-Dihydroxybenzoate biosynthesis (PWY-5901)

Y

Y