Functional pathways (meta pathways labels) | Clostridial strains | ||||
---|---|---|---|---|---|
WA | BC1 | WB | DSM 15410 | NCIMB 14988 | |
Carbohydrate metabolism | |||||
Beta-1,4-d-mannosyl-N-acetyl-d-glucosamine degradation (PWY-7586) | Y | ||||
Cellulose biosynthesis (PWY-1001) | Y | Y | |||
Cellulose degradation II (PWY-6788) | Y | Y | Y | Y | Y |
d-Galactose degradation V (Leloir pathway, PWY66-422) | Y | Y | Y | Y | |
d-Galacturonate degradation I (GALACTUROCAT-PWY) | Y | Y | |||
Ethanol degradation IV (PWY66-162) | Y | Y | Y | Y | |
Fucose degradation (FUCCAT-PWY) | Y | ||||
GDP-mannose biosynthesis (PWY-5659) | Y | ||||
Gellan degradation (PWY-6827) | Y | ||||
Gluconeogenesis I (GLUCONEO-PWY) | Y | Y | Y | ||
Glycerol degradation I (PWY-4261) | Y | Y | Y | Y | Y |
Glycogen biosynthesis I (GLYCOGENSYNTH-PWY) | Y | Y | |||
Glycolysis I (GLYCOLYSIS) | Y | Y | Y | Y | Y |
Glycolysis III (ANAGLYCOLYSIS-PWY) | Y | Y | Y | ||
Lactose degradation III (BGALACT-PWY) | Y | ||||
l-Ascorbate degradation II (PWY-6961) | Y | ||||
l-Rhamnose degradation I (RHAMCAT-PWY) | Y | ||||
Maltose degradation (MALTOSECAT-PWY) | Y | Y | |||
Pentose phosphate pathway (NONOXIPENT-PWY) | Y | Y | |||
Pyruvate fermentation to acetone (PWY-6588) | Y | Y | Y | Y | Y |
Pyruvate fermentation to butanoate (CENTFERM-PWY) | Y | ||||
Sucrose biosynthesis II (PWY-7238) | Y | Y | Y | Y | Y |
Sucrose degradation III (PWY-621) | Y | Y | |||
TCA cycle VIII (REDCITCYC) | Y | Y | Y | ||
Trehalose degradation I (TREDEGLOW-PWY) | Y | ||||
UDP-d-galactose biosynthesis (PWY-7344) | Y | Y | Y | Y | Y |
UDP-glucose biosynthesis (PWY-7343) | Y | Y | Y | Y | Y |
Energy metabolism | |||||
[2Fe-2S] iron-sulfur cluster biosynthesis (PWY-7250) | Y | Y | Y | Y | Y |
Hydrogen production (PWY-6759) | Y | Y | Y | Y | Y |
Hydrogen to dimethyl sulfoxide electron transfer (PWY0-1577) | Y | Y | Y | Y | Y |
Phosphatidylethanolamine biosynthesis I (PWY-5669) | Y | Y | Y | Y | |
Sulfoquinovosyl diacylglycerol biosynthesis (PWYQT-4427) | Y | ||||
Nitrogen fixation I (N2FIX-PWY) | Y | Y | Y | Y | |
Superoxide radicals degradation (DETOX1-PWY) | Y | ||||
Thioredoxin pathway (THIOREDOX-PWY) | Y | ||||
Urate biosynthesis/inosine 5-phosphate degradation (PWY-5695) | Y | ||||
Metabolism of cofactors, vitamins and others | |||||
Acetate conversion to acetyl-CoA (PWY0-1313) | Y | ||||
Acetate formation from acetyl-CoA I (PWY0-1312) | Y | Y | Y | Y | Y |
Acyl-CoA hydrolysis (PWY-5148) | Y | ||||
Phosphopantothenate biosynthesis I (PANTO-PWY) | Y | Y | Y | Y | Y |
Riboflavin metabolism (RIBOFLAVIN-PWY) | Y | Y | Y | Y | Y |
Fatty acid biosynthesis initiation I (PWY-4381) | Y | Y | |||
CDP-diacylglycerol biosynthesis III (PWY-5981) | Y | Y | Y | ||
Poly-hydroxy fatty acids biosynthesis (PWY-6710) | Y | Y | Y | Y | Y |
2,3-Dihydroxybenzoate biosynthesis (PWY-5901) | Y | Y |